Apuntes biográficos/históricosInvestigadora, hispanista y profesora española.
Se casó en 1951 con el profesor hispanista ucraniano Yaroslaw Flys, al que conoció en la Universidad de Madrid. Recién licenciados, se trasladaron a EEUU con una recomendación de Dámaso Alonso para el hispanista alemán Helmut Hatzfeld, de la Universidad Católica de Washington, donde impartió docencia. Fueron padres de Carmen Flys Junquera, doctora en filología inglesa.
Se incorporó a la Universidad Bowling Green de Ohio en 1963 y dirigió la parte española de los "Study Abroad", un programa permanente de estancias en España para alumnos estadounidenses.
Se doctoró en 1968 en la Universidad Central de Madrid con la tesis dirigida por Manuel Ballesteros: Los indios de Nuevo México, a través de las fuentes españolas. Consiguió una cátedra en la Bowling Green y ejerció allí la docencia hasta su jubilación, hacia 1993.
Como Mercedes Junquera de Flys, firmó su primer libro: Pioneros españoles en el Lejano Oeste (Doncel, 1976). Entre la producción bibliográfica de Junquera también destaca: Juan de Oñate y el paso del Río Grande: el Camino Real de Tierra Adentro, 1598-1988 (Ministerio de Defensa, 1998), que firmó junto al historiador y militar José Antonio Crespo-Francés. Autora de la primera edición crítica del primer poema épico de Norteamérica escrito por un europeo, el capitán Gaspar de Villagrá, en 1610: Historia de Nuevo México.